楼主，这个不好一概而论，简单的电路图，不考虑信号及高频干扰，可以选择自动布线，但要设置好规则。
自动布线是根据已有规则布线，布线速度快，但是灵活性比较低。正常来说，做工程的话，都是需要手工布线的。这是自动布线无法比拟的。如果是比较大的工程，信号线比较多，即使电路没有问题，使用自动布线后，单纯的高频干扰就很有可能使电路不能正常工作。如信号不同步，元器件因为导线间的干扰错误动作，等等。